1．单细胞蛋白的生产。SCP是指利用各种基质大规模培养细菌、酵母菌、霉菌、微藻、光合细菌等而获得的微生物蛋白，是现代饲料工业和食品工业中重要的蛋白来源。SCP营养丰富，蛋白质含量40％--80％不等，所含氨基酸组分齐全平衡，且有多种维生素，消化利用率高(一般高于80％)，其最大特点是原料来源广，微生物繁殖快，成本低，效益高。细胞和酵母利用甲醇、乙醇、甲烷和多链烷烃生产单细胞蛋白(SCP)；利用废物中的许多物质转化为SCP，如稻秸、蔗渣、柠蒙酸废料、果核、糖浆、动物粪便和污物等；利用藻类(如小球藻、栅藻)生产SCP。生产SCP的微生物有酵母、非病原性细菌、放线菌和真菌及藻类等，其中饲用酵母和藻类蛋白发展最快。生产SCP的主要原料有造纸工业的纸浆废液、制糖业的糖蜜及废弃物、酿酒业的糟类及废弃物等，利用各种植物秸秆、壳类、糖渣类、木屑等农村废弃物中的纤维素生产SCP。SCP饲料其菌体蛋白含量可达40％--80％，若加入限制性氨基酸蛋氨酸后可达90％以上，且各种氨基酸、维生素含量丰富。每千克SCP可使母牛产奶量增加6--7kg：用含10％SCP的饲料喂蛋鸡，产蛋量提高21％--35％，1t单细蛋白可节约饲粮5--7t。上海酵母厂通过特异生物技术培育成能富积微量元素的微生物。如硒酵母、锌酵母等：螺旋藻作为藻蛋白生产、已大面积培养推广，蛋白质含量达62％--70％，富含胡萝卜素、藻蓝蛋白、藻酸钠及类胰岛素等活性物质。
　　
　　2．新型饲料添加剂的生产。目前用作饲料添加剂的低聚糖主要有异麦芽低聚糖、半乳聚糖、甘露蜜寡糖、低聚葡萄糖、半乳蔗糖、大豆低聚糖、低聚果糖。与益生素相对应，寡糖等产品称为促生素(prebiotics)，它是为消化已有的有益细菌直接提供可发酵底物，促进有益微生物的大量增殖、调节消化道微生态平衡。这类产品分两类：一类是以促进有益细菌生长的低聚果糖，另一类是促进免疫反应的低聚甘露糖。卵黄抗体通过免疫反应阻止病原性大肠杆菌在小肠黏膜上黏着，从而预防和治疗仔猪的下痢。
　　
　　3．酶制剂。酶制剂是从动、植物和微生物中提取制备的具有酶特性的高效生物活性物质，通常与少量载体混合而制成粉剂。从微生物细胞制备酶的流程一般包括破碎细胞、溶剂抽提、离心、过滤、浓缩、干燥几个步骤，某些纯度要求很高的酶则需经几种方法乃至多次反复处理。应用生物技术生产的酶有：蛋白酶、纤维素酶、脂肪酶、乳糖酶、植酸酶、非淀粉多糖酶、果胶酶等。大多数酶来自真菌类，但最近的基因编码已将不同的酶如β-葡聚糖酶、木聚糖酶和植酸酶进行克隆。

　　植酸酶是一种水解植酸的磷酸酶类、它能将植物磷降解为肌醇和无机磷酸，饲料中添加植酸酶，可使饲料中磷的利用率提高60％，粪便中磷的排出量减少40％，有利于单胃动物对矿物质和氨基酸的吸收利用。β-萄聚糖酶、戊聚糖酶添加到以大麦、小麦、黑麦、燕麦等为主的饲粮中，能分解饲粮中的抗营养因子萄聚糖和戊聚糖，提高养分消化利用，改善了非滤粉多糖的消化率，降低了肉仔鸡和仔猪肠道内的黏性。研究表明，木聚糖酶、蛋白酶和淀粉酶的混合物可改善低黏性谷物如玉米、高粱的消化。
　　
　　4．降解秸秆木质素。木质素与纤维素之间形成坚固的酯键，阻碍了瘤胃微生物对纤维素的降解。英国ASTON大学从秸秆堆中分离出一种白腐真菌，只降解木质素、不降低纤维素，用白腐真菌发酵切碎的麦秸，5--6周后，不仅提高了蛋白质含量，可使秸秆的体外消化率从19．63％提高到41．13％。在适宜条件下，白腐真菌的菌丝首先用其分泌的超纤维氧化酶溶解表面的蜡质，然后菌丝进入秸秆内部并产生纤维素酶、半纤维素酶、内切聚糖酶、外切糖酶进行降解木质素和纤维素，使其成为含有酶的糖类，从而使秸秆饲料变得香甜可口，易于消化吸收。